Depuis 2015, le Parc Naturel de Portet-sur-Garonne est entièrement classé en Réserve naturelle régionale Confluence Garonne-Ariège (RNR). Située au sud de l’agglomération toulousaine, la Réserve naturelle s’étend sur près de 600 hectares sur un linéaire d’une quinzaine de kilomètres, depuis Venerque sur l’Ariège et Pinsaguel sur la Garonne, jusqu’à la chaussée de la Cavaletade à Toulouse.

Ce territoire est le refuge d’une riche biodiversité. L’alternance de bois, zones humides, falaises et espaces agricoles offre une diversité de paysages et une mosaïque de milieux naturels tout à fait remarquables. D’origine naturelle ou sous empreintes humaines, ces milieux sont propices à un grand nombre d’espèces animales et végétales, avec plus de 1 300 espèces recensées fin 2018.

L’objectif de chaque Réserve naturelle est de préserver ce qui a justifié son classement : espèces végétales ou animales, habitats naturels, objets géologiques… Pour l’ensemble des Réserves naturelles de France, il s’agit de contribuer, à l’échelle régionale, nationale et internationale, au maintien dans un bon état de conservation de la biodiversité, du patrimoine naturel et de toutes les fonctions et services rendus aux populations.

L’exploitation des gravières a marqué physiquement le Parc Naturel de Portet-sur-Garonne. Il en reste des traces aujourd’hui, bien identifiables avec la présence des fosses qui sont alimentées en eau par les crues ou les nappes phréatiques.

Elles donnent naissance à des zones humides de substitution, où une faune et une flore spécifiques se sont installées, dont certaines espèces présentant de forts enjeux de conservation comme la Cistude d’Europe, le Triton marbré, la Grenouille agile, le Butome en ombelle, l’Utriculaire australe ou encore le Grèbe castagneux et la Foulque macroule.

La confluence possède des milieux forestiers alluviaux d’intérêt et relictuels, devenus rares à l’échelle des vallées de la Garonne et de l’Ariège.

Dans cette partie du Parc, une zone marécageuse est favorable à la reproduction des poissons, dont le Brochet, mais elle est en voie d’atterrissement et d’envasement. Une avifaune nicheuse peu commune est présente dans le Parc Naturel de Portet-sur-Garonne, dont le Pigeon colombin, appréciant les vieux arbres à cavité, le Pic noir, le Pic mar.
La confluence en elle-même est une halte migratoire et zone d’hivernage pour plusieurs oiseaux d’eau et, sur une plage de graviers, un couple de Petit gravelot niche ponctuellement à l’abri des regards.

Dans le cadre du plan de gestion de la RNR et en partenariat avec la Ville de Portet-sur-Garonne, plusieurs aménagements ont été réalisés.

Plantation de haies afin de recréer des corridors écologiques, fermeture de sentiers afin de créer des zones de tranquillité pour éviter le dérangement de la faune, balisage randonnée et mise en place de système de canalisation sur les sentiers pour mieux orienter les visiteurs, création d’observatoires ornithologiques sur les étendues d’eau, pose de mobiliers en matériau naturel, traitement de plantes exotiques envahissantes…